Πολλές συνδικαλιστικές δυνάμεις αλλά και μεμονωμένοι εργαζόμενοι τόσο του ιδιωτικού όσο και του δημόσιου τομέα, έχουν την αντίληψη πως η ΓΣΕΕ κυριαρχείται χρόνια από συνδικαλιστικές δυνάμεις που την έχουν οδηγήσει σε εκφυλισμό. Πιο συγκεκριμένα, η ΓΣΕΕ κατηγορείται πως προωθεί τον κυβερνητικό συνδικαλισμό σε βάρος των συμφερόντων των εργαζομένων. Ένα μέρος των δυνάμεων που θέλουν να υπερβούν τον γραφειοκρατικό/κυβερνητικό συνδικαλισμό της ΓΣΕΕ στην κατεύθυνση της ταξικής ανασυγκρότησης του εργατικού/συνδικαλιστικού κινήματος, έχουν συγκροτήσει τον [[Συντονισμός Πρωτοβάθμιων Σωματείων|Συντονισμό Πρωτοβάθμιων Σωματείων]].
