Η Ζίλινα αγωνιζόταν για πολλά χρόνια στο πρωτάθλημα Τσεχοσλοβακίας. Συνολικά στις 31 αποαπό τις 48 σαιζόν αγωνιζόταν στην πρώτη κατηγορία και η μεγαλύτερη διακριση της στο πρωτάθλημα Τσεχοσλοβακίας ήταν η κατάληψη της 3ης θέσης τη σαιζόν 1946-47 πίσω αποαπό την [[Σπάρτα Πράγας]] και την [[Σλάβια Πράγας]]. Έπισης μεγάλη επιτυχία ήταν η παρουσία της στο τελικό του κυπέλλου Τσεχοσλοβακίας το [[1961]] και παρόλο που έχασε έπαιξε στο [[Κύπελλο Κυπελλούχων Ευρώπης|Κύπελλο Κυπελλούχων]] την επόμενη σαιζόν όπου και έφτασε ως τους 8 της διοργάνωσης. Μετά την διάλυση της [[Τσεχοσλοβακία|Τσεχοσλοβακίας]] το [[1993]] η Ζίλινα παίζει στην Α' κατηγορία στο Σλοβακικό Πρωτάθλημα με εξαίρεση την σαιζόν 1995-1996 όταν και υποβιβάστηκε στην Β' Κατηγορία. Έχοντας κατακτήσει 5 φορές τον τίτλο του Πρωταθλητή θεωρείται μία από τις μεγαλύτερες ομάδες στο εγχώριο πρωτάθλημα.
