<sup>1</sup>: Ο [[Ολυμπιακός Λευκωσίας|Ολυμπιακός]] τιμωρήθηκε με αφαίρεση 3 βαθμών πριν την έναρξη του πρωταθλήματος.<ref name="OLI">{{cite web|url = http://www.typos.com.cy/nqcontent.cfm?a_id=189547|title = Αφαίρεση βαθμών από τον Ολυμπιακό|publisher|date = 2012-05-22|accessdate = 2012-06-22|archiveurl = https://archive.is/kDUh|archivedate = 2012-09-14}}</ref> <br>
<sup>2</sup>: Η [[ΑΕΠ Πάφου|ΑΕΠ]] τιμωρήθηκε με αφαίρεση 12 βαθμών: Πριν την έναρξη του πρωταθλήματος τιμωρήθηκε με αφαίρεση 6 βαθμών.<ref>{{cite web|url = http://www.typos.com.cy/nqcontent.cfm?a_id=190682|title = Αφαίρεση τριών βαθμών|publisher|date = 2012-06-11|accessdate = 2012-06-22|archiveurl = https://archive.is/2l1M|archivedate = 2012-09-13}}</ref><ref>{{cite web|url = http://www.cfa.com.cy/Gr/news/11111|title = Αποφάσεις Πρωτοβάθμιας Επιτροπής Κριτηρίων|[[ΚΟΠ]]|date = 2012-08-13|accessdate = 2012-08-13|publisher = [[Κυπριακή Ομοσπονδία Ποδοσφαίρου|ΚΟΠ]]}}</ref> Το Νοέμβριο τιμωρήθηκε με αφαίρεση ακόμα 3 βαθμών.<ref>{{cite web|url = http://www.cfa.com.cy/Gr/news/12291|title = Αποφάσεις Πρωτοβάθμιας Επιτροπής Κριτηρίων|[[ΚΟΠ]]|date = 2012-11-12|accessdate = 2012-11-12|publisher = [[Κυπριακή Ομοσπονδία Ποδοσφαίρου|ΚΟΠ]]}}</ref> Το Μαΐο του 2013 και ενώ είχαν ολοκληρωθεί οι αγωνιστικές υποχρεώσεις της ομάδα, αφαιρέθηκαν άλλοι 3 βαθμοί από τη [[ΦΙΦΑ]].<ref>{{cite web|url = http://www.cfa.com.cy/Gr/news/14499|title = Αφαίρεση βαθμών από την ΑΕΠ και τον Ατρόμητο Γεροσκήπου|[[ΚΟΠ]]|date = 2013-05-13|accessdate = 2013-05-13|publisher = [[Κυπριακή Ομοσπονδία Ποδοσφαίρου|ΚΟΠ]]}}</ref>
