Στη συνέχεια με το πρόγραμμα ΚΑΛΛΙΚΡΑΤΗΣ στο Νομό Ρεθύμνου συστήθηκαν οι παρακάτω Δήμοι:
1. [[Δήμος '''Ρεθύμνης''']] με έδρα το Ρέθυμνο αποτελούμενος από τους δήμους α. Αρκαδίου β. Λαππαίων γ. Νικηφόρου Φωκά και δ. Ρεθύμνης, οι οποίοι καταργούνται.
2. [[Δήμος '''Μυλοποτάμου''']] με έδρα το Πέραμα αποτελούμενος από τους δήμους α. Γεροποτάμου β. Κουλούκωνα και την κοινότητα Ζωνιανών, οι οποίοι καταργούνται.
3. [[Δήμος '''Αμαρίου''']] με έδρα την Αγία Φωτεινή και ιστορική έδρα τον Φουρφουρά αποτελούμενος από τους δήμους α. Σιβρίτου και β. Κουρητών, οι οποίοι καταργούνται.
4. [[Δήμος '''Αγίου Βασιλείου''']] με έδρα το Σπήλι αποτελούμενος από τους δήμους α. Λάμπης και β. Φοίνικα, οι οποίοι καταργούνται.
Β. ΣτοΣτον δήμο[[δήμος '''Ανωγείων'''|Δήμο Ανωγείων]] δεν επέρχεται καμία μεταβολή.
Γ. Οι δήμοι '''Αμαρίου, Αγίου Βασιλείου και Ανωγείων''' χαρακτηρίζονται ως ορεινοί.