[[Αρχείο:Bal.Kyla.jpg|thumb|right|250px|O Πύργος του Βαλδουίνου στην Βουλγαρία, τόπος φυλάκισης του αυτοκράτορα απο τον Καλογιάννη.]]
Την επόμενη χρονιά (1204 - 1205) οι Λατίνοι επιχείρησαν να κατακτήσουν την [[Βιθυνία]] με αρχηγό τον [[Ερρίκος της Φλάνδρας|Ερρίκο]] νεώτερο γιοαδελφό του Βαλδουίνου αλλά οι Έλληνες αγρότες της Θράκης δυσαρεστημένοι από την βαριά φορολογία επαναστάτησαν εναντίον των Λατίνων, κάλεσαν για βοήθεια τον τσάρο των Βουλγάρων [[Καλογιάν της Βουλγαρίας|Καλογιάννη]] και του υποσχέθηκαν ότι θα του επιτρέψουν ότι θα στεφθεί ο ίδιος αυτοκράτορας. Η φρουρά της Ανδριανούπολης εξεγέρθηκε και ο Βαλδουίνος Α΄ ετοιμάστηκε για επίθεση εναντίον της πόλης μαζί με τον [[Ενρίκο Ντάντολο]], τον [[Λουδοβίκος του Μπλουά|Λουδοβίκο του Μπλουά]] και τον [[Γοδεφρείδος Βιλλεαρδουίνος|Γοδεφρείδο Βιλλεαρδουίνο]]. Στην μάχη της [[Αδριανούπολη|Ανδριανούπολης]] έξω από τα τείχη της πόλης (14 Απριλίου 1205) ο αυτοκράτορας Βαλδουίνος και οι σύμμαχοι του γνώρισαν την συντριβή από τον Καλογιάννη, ο Λουδοβίκος του Μπλουά σκοτώθηκε και ο Βαλδουίνος Α΄ συνελήφθη αιχμάλωτος.
Η τύχη του Βαλδουίνου μετά από αυτό το τραγικό γεγονός ήτανπαραμένει βέβαιηακόμα και σήμερα αβέβαιη, οι φήμες σχετικά με τον θάνατο του αυτοκράτορα διαφέρουν, μια φήμη λέει ότι τον σκότωσε ο Καλογιάννης όταν εξοργίστηκε από μια νέα εξέγερση στην [[Φιλιππούπολη]] άλλη φήμη έλεγε ότι τον σκότωσε ο Καλογιάννης όταν είδε τον Βαλδουίνο να γλυκοκοιτάζει την γυναίκα του, ο Καλογιάννης στην έγγραφη αναφορά του στον πάπα [[Πάπας Ιννοκέντιος Γ΄|Ιννοκέντιο Γ΄]] γράφει απλά ότι ο αυτοκράτορας Βαλδουίνος πέθανε στην φυλακή. Ο γνωστός Βυζαντινός ιστορικός [[Γεώργιος Ακροπολίτης]] έγραφε σύμφωνα με γνωστό θρύλο ότι ο Καλογιάννης χρησιμοποιούσε το κρανίο του Βαλδουίνου Α΄ σαν κύπελλο για να πίνει νερό όπως έκανε 3 αιώνες πιο πριν ο Βούλγαρος χάνος [[Κρούμος]] με τον Βυζαντινό αυτοκράτορα [[Νικηφόρος Α´|Νικηφόρο Α΄]], τον διαδέχθηκε ο αδελφός του [[Ερρίκος της Φλάνδρας]].
