===Ο αντίκτυπος της εναλλαγής μέρας-νύχτας (ή φωτός-σκότους)===
Ο κιρκάδιος ρυθμός είναι στενά συνδεδεμένος με τον κύκλο μέρα-νύχτα (ή φως-σκοτάδι). Ζώα, συμπεριλαμβανομένου και του ανθρώπου, τα οποία κρατιούνται σε απόλυτο σκοτάδι για μεγάλα χρονικά διαστήματα, τελικά αναπτύσσουν ένα free-running ρυθμό, ένα ρυθμό δηλαδή που δεν είναι προσαρμοσμένος ούτε στον 24ωρο κύκλο της φύσης, ούτε σε κάποιον άλλο τεχνητό κύκλο. Ο κύκλος ύπνου αυτών των ζώων και εξαρτάται από το εάν η "ημέρα" τους είναι μικρότερη ή μεγαλύτερη από 24 ώρες.<ref name=health.am>{{MEDRS|date=November 2013}} {{Cite web |author=Shneerson, J.M.; Ohayon, M.M.; Carskadon, M.A. |title=Circadian rhythms |publisher=Armenian Medical Network |work=Rapid eye movement (REM) sleep |url=http://www.sleep.health.am/sleep/more/circadian-rhythms/ |year=2007 |accessdate=2007-09-19}}</ref> Εντελώς τυφλά θηλαστικά, που ζούνε κάτω από το έδαφος (όπως πχ ο τυφλοπόντικας), έχουν την ικανότητα να διατηρούν τον ενδογενή ρυθμό τους, παρά την απουσία εξωτερικών ερεθισμάτων. Αν και δεν έχουν όραση, διαθέτουν μάτια με φωτοϋποδοχείς (για την ανίχνευση του φωτός), ενώ περιοδικά βγαίνουν και στην επιφάνεια της γης.<ref>"The Rhythms of Life: The Biological Clocks That Control the Daily Lives of Every Living Thing" Russell Foster & Leon Kreitzman, Publisher: Profile Books Ltd.</ref>
