Σαράντα ημέρες<ref name="Μουρούζης"/> μετά τον διορισμό του αποκεφαλίστηκε. Τις συνθήκες αποκεφαλισμού του περιγράφει ο ιερέας της αγγλικής πρεσβείας στην Κωνσταντινούπολη R. Walsh: ο Μουρούζης περνούσε έφιππος κοντά στην ακτή του Βοσπόρου, όταν τον πλησίασε κάποιος και του ενεχείρισε έναμία γράμμαεπιστολή του [[Αλέξανδρος Υψηλάντης|Αλέξανδρου Υψηλάντη]], που τον καλούσε να συμμετάσχει στην προετοιμασία του Αγώνα:· ο Μουρούζης έσπευσε να ειδοποιήσει τους Υπουργούς της Πύλης. Εκείνοι τον συμβούλευσαν να τη μεταφράσει στο σουλτάνο, παραλείποντας τμήμα της επιστολής, που αναφερόταν σε πρόσωπα πολύ γνωστά. Όταν όμως ο σουλτάνος ζήτησε να του την μεταφράσει και ένας Ρωμιός κηπουρός, διαπίστωσε την παράλειψη και έδωσε εντολή να αποκεφαλιστεί:· η εκτέλεση πραγματοποιήθηκε στο γνωστό κιόσκι μπροστά στον ίδιο τον σουλτάνο.<ref>Κυριάκος Σιμόπουλος, Πώς είδαν οι ξένοι την Ελλάδα του 21, 1ος τόμος 1821-1822, εκδ. Στάχυ, Αθήνα, 1999, σελ. 121</ref>
