Ο Εμβέρ Μπέης γεννήθηκε στην [[Κωνσταντινούπολη]] και ήταν παιδί οικογένειας που τα έφερνε δύσκολα πέρα. Κατά τον ιστορικό [[Μαρκ Μαζάουερ]] (σε μια εποχή όπου η καταγραφή των πολιτών είχε σοβαρές ατέλειες) ο πατέρας του ήταν Τούρκος από το [[Μοναστήρι (ΠΓΔΜΒόρεια Μακεδονία)|Μοναστήρι]], φύλακας σε μια γέφυρα και η μητέρα του [[Αλβανία|Αλβανίδα]] χωρική. Ήταν ο πρωτότοκος της οικογένειας. Σπούδασε από έφηβος σε διάφορες προπαρασκευαστικές και ανώτερες στρατιωτικές σχολές της Αυτοκρατορίας και ολοκλήρωσε τις μακρόχρονες σπουδές του με την αποφοίτησή του από τη Στρατιωτική Ακαδημία Χαρπ της [[Άγκυρα]]ς το 1903 με το βαθμό του [[Λοχαγός|Λοχαγού]]. Το 1906 προήχθη στο βαθμό του [[Ταγματάρχης|Ταγματάρχη]] και μετατέθηκε στην [[3η Στρατιά (Οθωμανική Αυτοκρατορία)|3η Οθωμανική Στρατιά]] με έδρα την υπό τουρκική ακόμα κατοχή [[Θεσσαλονίκη]]. Ενώ υπηρετούσε στη Θεσσαλονίκη, έγινε μέλος και στη συνέχεια ηγέτης του Κομιτάτου ''Ένωση και Πρόοδος'' (İttihat ve Terakki Cemiyeti), μυστικής εταιρείας που οδήγησε στο ''Κίνημα των Νεοτούρκων''.
