Αθλητική Ένωση Καραϊσκάκης: Διαφορά μεταξύ των αναθεωρήσεων

Τον Σεπτέμβριο του 2016 βγήκε κοινή ανακοίνωση με την διοίκηση της [[Γ.Α.Σ. Αναγέννηση Άρτας|Αναγέννησης Άρτας]] για συνεργασία και κοινή πορεία των δυο ομάδων.<ref>{{Cite web|url=http://www.sportime24.gr/ae-karaiskakis-anagennisi-synergasia/|title=Έναρξη συνεργασίας του ΓΑΣ Αναγέννησης Άρτας και της ΑΕ Καραϊσκάκης Άρτας|last=|first=|date=19/09/ Σεπτεμβρίου 2016|website=|publisher=|archiveurl=|archivedate=|accessdate=}}</ref>Η συνεργασία τελικά δεν υλοποιήθηκε. Στο τέλος της περιόδου [[Γ΄ Εθνική ποδοσφαίρου ανδρών 2016-2017|2016-17]] η ομάδα <nowiki/>τερμάτισε στη δεύτερη θέση, για τρίτη συνεχόμενη χρονιά. Μετά το τέλος του πρωταθλήματος η ομάδα κατάφερε να κερδίσει το [[Κύπελλο Γ΄ Εθνικής ποδοσφαίρου|Κύπελλο Γ' εθνικής]] [[Κύπελλο Γ΄ Εθνικής 2016-17|2016-17]]. Σαν κυπελλούχος διεκδίκησε με τον [[Π.Α.Σ.Α. Ηρόδοτος|Ηρόδοτο]] το [[Σούπερ Καπ Ερασιτεχνών ποδοσφαίρου Ελλάδος]], όπου ηττήθηκε με 1-0.<ref>{{Cite web|url=https://www.grandsport.gr/522856/apisteftos-irodotos-kerdise-0-1-tin-ae-karaiskaki-ke-pire-ke-to-4o/|title=Απίστευτος Ηρόδοτος κέρδισε 0-1 την ΑΕ Καραϊσκάκη και πήρε και το… 4ο!|last=|first=|date=4/6/17 Ιουνίου 2017|website=|publisher=|archiveurl=|archivedate=|accessdate=}}</ref>

Το καλοκαίρι του 2017, η [[Ελληνική Ποδοσφαιρική Ομοσπονδία|ΕΠΟ]] αρχικά αποφάσισε να καλύψει το κενό μιας ομάδας στην Β' εθνική με τους δευτεραθλητές της [[Γ΄ Εθνική ποδοσφαίρου ανδρών 2016-2017|Γ' εθνικής 2016-17]], υπό την προϋπόθεση ότι θα καταθέσουν εγγυητική 300.000€. Οι μόνες ομάδες που το έκαναν ήταν ο Καραϊσκάκης και η [[Γ.Σ. Δόξα Δράμας|Δόξα Δράμας]].<ref>{{Cite web|url=http://www.sport24.gr/football/ellada/BEth/mparaz-anodoy-sth-football-league-gia-doksa-dramas-ae-karaiskakhs.4808059.html|title=Μπαράζ ανόδου στη Football League για Δόξα Δράμας - ΑΕ Καραϊσκάκης|last=|first=|date=17 Αυγούστου 2017|website=|publisher=|accessdate=}}</ref>Το μπαράζ ορίστηκε να γίνει στην Κατερίνη. Τελικά με νέα απόφαση της, η ΕΠΟ ματαίωσε το μπαράζ ανόδου.<ref>{{Cite web|url=http://www.egnomi.gr/article/84470/mataiwthike_to_mparaz_metaxy_tis_doxas_dramas_kai_tis_ae_karaiskakis.html?category_id=9|title=Ματαιώθηκε το μπαράζ μεταξύ της Δόξας Δράμας και της ΑΕ Καραϊσκάκης|last=|first=|date=28 Αυγούστου 2017|website=|publisher=|accessdate=}}</ref>Μετά από προσφυγή της Δόξας Δράμας κατά της απόφασης της ΕΠΟ, το διαιτητικό δικαστήριο της ΕΠΟ αποφάσισε να γίνει το μπαράζ.<ref>{{Cite web|url=http://www.liganews.gr/g-ethniki-7/item/12712-apofasi-gia-baraz|title=Απόφαση για μπαράζ!|last=|first=|date=055 Σεπτεμβρίου 2017|website=|publisher=|archiveurl=|archivedate=|accessdate=}}</ref> Μετά την απόσυρση του [[Ηρακλής Θεσσαλονίκης (ποδόσφαιρο)|Ηρακλή]] από την Β' Εθνική, ο αγώνας ματαιώθηκε και οι δυο ομάδες προβιβάστηκαν στην Β' εθνική.<ref>{{Cite web|url=http://www.epo.gr/News.aspx?a_id=47453&NewsType=21|title=Απόφαση Επιτροπής Εκτάκτων Θεμάτων (11/9)|last=|first=|date=11 Σεπτεμβρίου 2017|website=|publisher=|accessdate=}}</ref>Το [[Β΄ Εθνική ποδοσφαίρου ανδρών 2017-18|2017-18]] συμμετέχοντας για πρώτη φορά στην ιστορία του στην δεύτερη κατηγορία,τερμάτισε στην 8η θέση και παρέμεινε άνετα στην κατηγορία.Το [[Β΄ Εθνική ποδοσφαίρου ανδρών 2018-19|2018-19]] τερμάτισε στην 10η θέση εξασφαλίζοντας την παραμονή του στην κατηγορία.Σύμφωνα με την αναδιάρθρωση ο Καραισκάκης συμμετέχει στην νεοσύστατη [[Α2 Εθνική ποδοσφαίρου ανδρών|Super League 2]],στην ουσία όμως συμμετέχει ξανά στην δεύτερη κατηγορία.