Το 2006, αναγορεύτηκε από το [[Πανεπιστήμιο Πελοποννήσου]], [[επίτιμος διδάκτορας|επίτιμος διδάκτωρ]] της Σχολής Επιστημών Ανθρώπινης Κίνησης και Ποιότητας Ζωής.
Σε μαγνητοσκοπημένες συνομιλίες που εξέτασαν οι ανακρίτριες που διεξήγαγαν την ανάκριση για τη [[δίκη της Χρυσής Αυγής]], στις οποίες σχολιαζεσχολίαζε Έλληνες ιεράρχες που υποστηρίζουν τη ΧΑ, ο αρχηγός της [[Νίκος Μιχαλολιάκος|Μιχαλολιάκος]] είπε ότι ο Ευστάθιος θα είχε εκλεγεί [[αρχιεπίσκοπος Αθηνών]] αντί του [[Αρχιεπίσκοπος Ιερώνυμος Β΄|Ιερωνύμου]], εάν είχε τη στήριξη του [[Άνθιμος Ρούσσας|Άνθιμου]], και ότι είναι «καθαρός» και «πολύ καλός, δέχτηκε τα παιδιά από την τοπική οργάνωση, έβαλε ένα ολόκληρο γηροκομείο και μας ψήφισε στις εκλογές».<ref>{{Cite web|url=http://www.tovima.gr/society/article/?aid=548747|title=tovima.gr - Ν. Μιχαλολιάκος: Ποιοι ιεράρχες στηρίζουν την Χρυσή Αυγή|last=Α.Ε.|first=tovima.gr — Δημοσιογραφικός Οργανισμός Λαμπράκη|website=TO BHMA|accessdate=2017-12-14}}</ref> Ο Ευστάθιος διέψευσε τις δηλώσεις Μιχαλολιάκου λέγοντας πως «δεν υπάρχει γηροκομείο που να είναι υπό τον έλεγχο της Μητρόπολης».<ref>{{Cite news|url=http://www.skai.gr/news/greece/article/247967/anupostatoi-oi-ishurismoi-mihalioliakou-apada-o-mitropolitis-spartis/#ixzz2nOWGXOuE|title=Ανυπόστατοι οι ισχυρισμοί Μιχαλιολιάκου, απαντά ο Μητροπολίτης Σπάρτης|last=ΣΚΑΪ|language=el|accessdate=2017-12-14}}</ref>
