Ο Γκατούζο ξεκίνησε την καριέρα του το [[1990]] στα μικρά τμήματα της [[ΠερούτζιαΠερούτζα Κάλτσιο|ΠερούτζιαΠερούτζα]]. Τον Ιούλιο του [[1997]] στην ηλικία των 19 ετών μετακόμισε στην Σκωτία και την [[Ρέιντζερς Γλασκώβης]]. Έμεινε λίγο στη [[Σκωτία]] με την αποχώρηση του Γουόλτερ Σμιθ του προπονητή που τον πήρε στην ομάδα από τον πάγκο της ομάδας και την ανάληψη της τεχνικής ηγεσίας από τον Αντβοκατ τον Οκτώβριο του [[1998]] επέστρεψε στην [[Ιταλία]] και την Σαλερνιτάνα έναντι 4 εκατομυρίων λιρών. Στη Σαλερνιτάνα παρά τις καλές εμφανίσεις του,αυτό δεν ήταν αρκετό για να αποφύγει η ομάδα τον υποβιβασμό. Οι εμφανίσεις του ομώς κίνησαν το ενδιαφέρον της Μίλαν που τον ενέταξε στο δυναμικό της το [[1999]]. Στη Μίλαν βρήκε γρήγορα θέση βασικού ως μέλος της ομάδας κατέκτησε δύο φορές το [[ΟΥΕΦΑ Τσάμπιονς Λιγκ|Τσάμπιονς Λιγκ]], μία φορά το [[Σέριε Α|Πρωτάθλημα Ιταλίας]], μία φορά το [[Κύπελλο Ιταλίας]],<ref>{{Cite web|url=http://www.rediff.com/sports/2003/jun/01milan.htm|title=AC Milan win Italian Cup|website=www.rediff.com|accessdate=2018-04-10}}</ref> δύο φορές το [[ΟΥΕΦΑ Σούπερ Καπ]] και μια φορά το [[Παγκόσμιο κύπελλο συλλόγων]].<ref>{{Cite web|url=http://www.fifa.com/clubworldcup/matches/round=249933/match=61295/index.html|title=FIFA Club World Cup Japan 2007 - Matches - Boca Juniors-AC Milan - FIFA.com|last=FIFA.com|website=FIFA.com|language=en-GB|accessdate=2018-04-10}}</ref>
