Αξιοσημείωτη είναι η πορεία της στο θέατρο. Από το 1990 μέχρι το 1996, έπαιζε αποκλειστικά σε παραστάσεις του Θεάτρου Τέχνης του [[Κάρολος Κουν|Καρόλου Κουν]]. Στη συνέχεια, συνεργάστηκε με το Θέατρο Τζένη Καρέζη, το Θέατρο Δημήτρη Χορν, με το [[Εθνικό Θέατρο]], καθώς και με πολλά άλλα. Επιπρόσθετα, τα τελευταία χρόνια, έχει εργαστεί και ως σκηνοθέτις, βοηθός σκηνοθέτη και σκηνογράφος, ενώ έχει αναλάβει τη διασκευή, τη μουσική επιμέλεια και έχει εμπνευστεί το σενάριο ορισμένων έργων.<ref>{{Cite web|url=https://www.unstage.gr/sintelestes/Maria-Protopappa|title=Μαρία Πρωτόπαππα|website=unstage.gr|language=el|accessdate=2020-04-21}}</ref>