Η αυτοάνοση ασθένεια μπορεί να προκύψει από την ανώμαλη αναγνώριση των Β κυττάρων των αυτοαντιγόνων που ακολουθείται από την παραγωγή αυτοαντισωμάτων.<ref name=":16">{{Cite journal|title = B-lymphocyte contributions to human autoimmune disease|journal = Immunological Reviews|date = 2008-06-01|issn = 1600-065X|pages = 284–299|volume = 223|issue = 1|doi = 10.1111/j.1600-065X.2008.00646.x|pmid = 18613843|first1 = Koichi|last1 = Yanaba|first2 = Jean-David|last2 = Bouaziz|first3 = Takashi|last3 = Matsushita|first4 = Cynthia M.|last4 = Magro|first5 = E. William|last5 = St.Clair|first6 = Thomas F.|last6 = Tedder}}</ref> Τα αυτοάνοσα νοσήματα όπου η δραστηριότητα της νόσου συσχετίζεται με τη δραστηριότητα των Β κυττάρων περιλαμβάνουν [[σκληρόδερμα|σκληροδερμία]], [[πολλαπλή σκλήρυνση]], [[συστημικός ερυθηματώδης λύκος|συστηματικό ερυθηματώδη λύκο]], [[διαβήτης (ασθένεια)|διαβήτη τύπου 1]], [[σύνδρομο ευερέθιστου εντέρου|μεταλοιμώδης IBS]] και [[ρευματοειδής αρθρίτιδα|ρευματοειδή αρθρίτιδα]].<ref name=":16" />
[[Κακοήθης μετασχηματισμός]] των Β κυττάρων και των προδρόμων τους μπορεί να προκαλέσουν ένα πλήθος [[καρκίνουκαρκίνος|καρκίνων]], συμπεριλαμβανομένωνπου [[Β λεμφοκυτταρικής χρόνιας λευχαιμίας των κυττάρων Β |συμπεριλαμβάνουν χρόνια λεμφοκυτταρική λευχαιμία (CLL)]], [[Οξεία λεμφοβλαστική λευχαιμία | οξεία λεμφοβλαστική λευχαιμία (ΟΛΛALL)]], [[λευχαιμία τριχωτών κυττάρων]], [[θυλακοειδές λέμφωμα]], [[λέμφωμα μη-Hodgkin | λέμφωμα μη Hodgkin]], [[λέμφωμα Hodgkin]], και [[δυσκρασία κυττάρων πλάσματοςκακοήθειες |κακοήθειες των κυττάρων πλάσματος]]πλασματοκυττάρων όπως [[πολλαπλούν μυέλωμα|πολλαπλό μυέλωμα]], [[μακροσφαιριναιμία του Waldenström]] και ορισμένες μορφές [[αμυλοείδωσηςαμυλοείδωση]]ς.<ref>{{Cite journal|title = Pathogenesis of Human B Cell Lymphomas|journal = Annual Review of Immunology|date = 2012-01-01|pmid = 22224767|pages = 565–610|volume = 30|issue = 1|doi = 10.1146/annurev-immunol-020711-075027|first1 = Arthur L. Shaffer|last1 = III|first2 = Ryan M.|last2 = Young|first3 = Louis M.|last3 = Staudt|pmc = 7478144}}</ref><ref name="pmid27866585">{{cite journal | vauthors = Castillo JJ | title = Plasma Cell Disorders | journal = Primary Care | volume = 43 | issue = 4 | pages = 677–691 | year = 2016 | pmid = 27866585 | doi = 10.1016/j.pop.2016.07.002 }}</ref>
[[Malignant transformation]] of B cells and their precursors can cause a host of [[cancer]]s, including [[B-cell chronic lymphocytic leukemia|chronic lymphocytic leukemia (CLL)]], [[Acute lymphoblastic leukemia|acute lymphoblastic leukemia (ALL)]], [[hairy cell leukemia]], [[follicular lymphoma]], [[Non-Hodgkin lymphoma|non-Hodgkin's lymphoma]], [[Hodgkin's lymphoma]], and [[Plasma cell dyscrasia|plasma cell malignancies]] such as [[multiple myeloma]], [[Waldenström's macroglobulinemia]], and certain forms of [[amyloidosis]].<ref>{{Cite journal|title = Pathogenesis of Human B Cell Lymphomas|journal = Annual Review of Immunology|date = 2012-01-01|pmid = 22224767|pages = 565–610|volume = 30|issue = 1|doi = 10.1146/annurev-immunol-020711-075027|first1 = Arthur L. Shaffer|last1 = III|first2 = Ryan M.|last2 = Young|first3 = Louis M.|last3 = Staudt|pmc = 7478144}}</ref><ref name="pmid27866585">{{cite journal | vauthors = Castillo JJ | title = Plasma Cell Disorders | journal = Primary Care | volume = 43 | issue = 4 | pages = 677–691 | year = 2016 | pmid = 27866585 | doi = 10.1016/j.pop.2016.07.002 }}</ref>
