Η Πρωτοζωολογία αποτελεί ιδιαίτερο κλάδο της Ζωολογίας που κύριο αντικείμενο έρευνας και μελέτης της είναι τα πρωτόζωα.

Ο επιστημονικός αυτός κλάδος άρχισε ν΄ αναπτύσσεται περίπου από το β΄ μισό του 17ου αιώνα όταν τότε ο Ολλανδός ερευνητής Άντον φον Λέβενχουκ κατάφερε με το μικροσκόπιό του ν΄ ανακαλύψει πρώτος αυτός τα πρωτόζωα.