Στις [[24 Ιανουαρίου]] [[1996]] πραγματοποίησε το ντεμπούτο του με την [[Εθνική Ελλάδας (ποδόσφαιρο ανδρών)|Εθνική Ανδρών]], στην εντός έδρας φιλική αναμέτρηση εναντίον του [[Εθνική Ισραήλ (ποδόσφαιρο ανδρών)|Ισραήλ]] (2-1).,<ref>{{Cite web|url = http://www.epo.gr/media/files/ETHNIKES_OMADES/MATCH_ANDRES_1929-2000/ethniki_andrwn_1996_2000.pdf|title = Εθνική Ανδρών 1996-2000}}</ref> Σκόραρεενώ σημείωσε το πρώτο του γκολτέρμα στις [[15 Οκτωβρίου]] του [[1998]] απέναντι στη [[Εθνική Γεωργίας (ποδόσφαιρο ανδρών)|Γεωργία]] (3-0).<ref>{{Cite web|url = http://www1.rizospastis.gr/storyPlain.do?id=3744207|title = Ριζοσπάστης: ΕΛΛΑΔΑ - ΓΕΩΡΓΙΑ 3-0}}</ref> Το 2004 δεν κλήθηκε να συμμετάσχει στην αποστολή στην Πορτογαλία για το Ευρωπαϊκό Πρωτάθλημα.
ΟΠαρά το γεγονός ότι δεν ήταν στις επιλογές του [[Ότο Ρεχάγκελ]] για το [[Ευρωπαϊκό Πρωτάθλημα Ποδοσφαίρου 2004|Euro 2004]], o ρόλος του ήταν καθοριστικός στην πορεία της Ελλάδας προς το [[Ευρωπαϊκό Πρωτάθλημα Ποδοσφαίρου 2008|Euro 2008]], καθώς στην [[Προκριματικά Ευρωπαϊκού Πρωταθλήματος 2008|προκριματική φάση]] σημείωσε καθοριστικά γκολτέρματα στους αγώνες εναντίον της [[Εθνική Βοσνίας και Ερζεγοβίνης (ποδόσφαιρο ανδρών)|Βοσνίας - Ερζεγοβίνης]] (3-2),<ref>{{Cite web|url = http://www.sport24.gr/football/ellada/ethniki_elladas/article297773.ece|title = Ελλάδα-Βοσνία: 3-2}}</ref> της [[Εθνική Μολδαβίας (ποδόσφαιρο ανδρών)|Μολδαβίας]] εντός έδρας (2-1)<ref>{{Cite web|url = http://www.contra.gr/Soccer/Europe/Euro/article1034087.ece|title = Ελλάδα - Μολδαβία 2-1}}</ref> και εκτός έδρας (0-1),<ref>{{Cite web|url = http://www.contra.gr/Soccer/Europe/Euro/article1144397.ece|title = Μολδαβία-Ελλάδα 0-1}}</ref> με αποτέλεσμα ο [[ΌτοΓερμανός Ρεχάγκελ]]προπονητής να τον συμπεριλάβει στην αποστολή για την τελική φάση της διοργάνωσης, όπου αγωνίστηκε σε έναν αγώνα (εναντίον της [[Εθνική Ρωσίας (ποδόσφαιρο ανδρών)|Ρωσίας]]).
Υπήρξε βασικό στέλεχος της Ελλάδας ως το 2009, πουόταν αποφάσισε να αποχωρήσει. Τον Οκτώβριο του 2010 όμως επέστρεψε όταν κλήθηκε ξανά από τον νέο ομοσπονδιακό προπονητή [[Φερνάντο Σάντος]]. ΔήλωσεΗ την οριστικήτελευταία του αποχώρησησυμμετοχή μετάήταν τονστον αγώνα μετων τηπροημιτελικών του [[ΕθνικήΕυρωπαϊκό ΓερμανίαςΠρωτάθλημα (ποδόσφαιροΠοδοσφαίρου ανδρών)2012|ΓερμανίαEuro 2012]] στοεναντίον της [[ΕυρωπαϊκόΕθνική ΠρωτάθλημαΓερμανίας Ποδοσφαίρου(ποδόσφαιρο 2012ανδρών)|Ευρωπαϊκό Πρωτάθλημα του 2012Γερμανίας]],<ref>{{Cite web|url = http://www.sport24.gr/football/ellada/ethniki_elladas/ta_katorthwmata_toy_lymperopoyloy_me_thn_ethnikh_elladas.1827975.html|title = Τα κατορθώματα του Λυμπερόπουλου με την Εθνική Ελλάδας}}</ref> ενώ το τελευταίο του γκολτέρμα σημειώθηκε σε φιλικό αγώνα απέναντι στην [[Εθνική Ουγγαρίας (ποδόσφαιρο ανδρών)|Ουγγαρία]].<ref>{{Cite web|url = http://www.sport-fm.gr/article/132143|title = Ουγγαρία - Ελλάδα 3-2 (Τελικό)}}</ref> Με την Ελλάδα πέτυχε 13 τέρματα σε 76 συνολικά εμφανίσεις, καταλαμβάνοντας έτσι τη δέκατη θέση στον σχετικό πίνακα με τους σκόρερ όλων των εποχών.<ref>[http://sports.in.gr/football/article/?aid=1231212261 Η πρώτη δεκάδα των σκόρερ της Εθνικής]</ref>
Υπήρξε βασικό στέλεχος και της [[Εθνική Ελπίδων Ελλάδος (ποδόσφαιρο)|Εθνικής Ελπίδων]] που έλαβε μέρος στον τελικό του [[Ευρωπαϊκό πρωτάθλημα ποδοσφαίρου U21|Ευρωπαϊκού Πρωταθλήματος Ελπίδων (Κ-21)]] το 1998, εναντίον της Ισπανίας.
