Ο Μαργιωρής, θεωρούσε τη Μεταφυσική σαν τη μόνη Αλήθεια, πιστεύοντας πως είναι δυνατό ο άνθρωπος να πραγματώσει την Αλήθεια. Όλες του οι διδασκαλίες και τα βιβλία του, οι μελέτες του και οι κλάδοι σπουδών του Εσωτερισμούεσωτερισμού, είναι προερχόμενοι και απορρέουν, από τα βαθιά μυστικιστικά του βιώματα. Από πολλή μικρή ηλικία ήταν κοινωνός των υπερβατικών αυτών καταστάσεων, τις οποίες κατόρθωνε να παρέχει στους μαθητές του και στον κόσμο.<ref name=bionm/>
Το συγγραφικό έργο του Μαργιωρή ασχολείται με θέματα όπως η [[αριθμοσοφιααριθμοσοφία],<ref>{{Cite book|title = Η πυθαγόρεια αριθμοσοφία|last = Μαργιωρής|first = Νικόλαος|publisher = Εκδόσεις Νικολάου Α. Μαργιωρή|year = 2000|isbn = 978-960-7152-06-0|location = |pages = |url = http://www.biblionet.gr/book/47163/%CE%9C%CE%B1%CF%81%CE%B3%CE%B9%CF%89%CF%81%CE%AE%CF%82,_%CE%9D%CE%B9%CE%BA%CF%8C%CE%BB%CE%B1%CE%BF%CF%82_%CE%91./%CE%97_%CF%80%CF%85%CE%B8%CE%B1%CE%B3%CF%8C%CF%81%CE%B5%CE%B9%CE%B1_%CE%B1%CF%81%CE%B9%CE%B8%CE%BC%CE%BF%CF%83%CE%BF%CF%86%CE%AF%CE%B1}}</ref> που θεωρούνται [[ψευδομαθηματικά]] ή ψευδοεπιστήμη, από τους επιστήμονες<ref>[http://www.scienceinafrica.co.za/2001/may/numerol.htm Φεμινιστική αριθμολογία] από τον καθ. John Webb, Science in Africa</ref> . Βιβλία του όπως το «''Δραβίδες οι πρόγονοι των Ελλήνων''» ανήκουν στο ρεύμα του [[νεοπυθαγορισμου]]νεοπυθαγορισμού. Επικαλείται ως γεγονότα μύθους, όπως ο πόλεμος των Ατλάντων εναντίων των ΔραβίδωνΔραβιδών,<ref>{{Cite web|url = http://www.biblionet.gr/book/47176/%CE%9C%CE%B1%CF%81%CE%B3%CE%B9%CF%89%CF%81%CE%AE%CF%82,_%CE%9D%CE%B9%CE%BA%CF%8C%CE%BB%CE%B1%CE%BF%CF%82_%CE%91./%CE%94%CF%81%CE%B1%CE%B2%CE%AF%CE%B4%CE%B5%CF%82_%CE%BF%CE%B9_%CF%80%CF%81%CF%8C%CE%B3%CE%BF%CE%BD%CE%BF%CE%B9_%CF%84%CF%89%CE%BD_%CE%95%CE%BB%CE%BB%CE%AE%CE%BD%CF%89%CE%BD|title = Δραβίδες οι πρόγονοι των Ελλήνων|website = biblionet.gr}}</ref> τον οποίο προσδιορίζει χρονικά στα 12-16,000 χρόνια π.Χ., εποχή για την οποία δεν υπάρχουν μαρτυρίες. Στη «''Θεραπευτική με δίχως φάρμακα, χειροπλαστική» ''παρουσιάζει [[Εναλλακτική ιατρική|εναλλακτικές θεραπευτικές μεθόδους]], οι οποίες σύμφωνα με τους σκεπτικιστές, εμπίπτουν στην [[αγυρτεία]].<ref>{{Cite web|url = http://www.skepdic.gr/entries/Alpha/agyrteia.htm|title = Αγυρτεία|website = |publisher = Το λεξικό του σκεπτικιστή}}</ref>
==Δράση==
* Το 1972 ίδρυσε το σωματείο «Ευσεβείς Προσκυνητές του Ακτίστου Φωτός ο Άγιος Πατάπιος».
* Το 1976 προχώρησε στην ίδρυση του σχολείου «Ομακοείο Αθηνών», το οποίο ήταν και συνεχιζεισυνεχίζει μεχριμέχρι σημερασήμερα ως μια Σχολή Μεταφυσικής Φιλοσοφίας και [[Γιόγκα]]. Σε αυτό δίδαξε την Εσωτερική Φιλοσοφία: τη μέθοδο ανύψωσης του νου στην υπερσυνείδηση (Ράτζα Γιόγκα) την ψυχοσωματική θεραπεία (Κρίγια Γιόγκα) κ.ά.<ref name=dimbio/>
