Στην πόλη λειτουργούν πλέον δύο ανώτατες σχολές: το Τμήμα Επιστημών Φυσικής Αγωγής και Αθλητισμού (ΤΕΦΑΑ)<ref>[http://www.pe.uth.gr/cms/ ΤΕΦΑΑ Τρικάλων]</ref> του [[Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας|Πανεπιστημίου Θεσσαλίας]], πρωτολειτούργησε το ακαδημαϊκό έτος 1994-95. Από το καδημαϊκόΑκαδημαϊκό έτος 2014-15 αναβαθμίστηκε σε ΣχοληΣχολή και πλέον ονομάζεται Σχολή Επιστήμης Φυσικής Αγωγής και Αθλητισμού<ref>{{Cite web|title = ΤΕΦΑΑ - DPESS - Αρχική Σελίδα του ΤΕΦΑΑ ΠΘ|url = http://www.pe.uth.gr/cms/|website = www.pe.uth.gr|accessdate = 2015-10-26}}</ref> (ΣΕΦΑΑ). Από το ακαδημαϊκό έτος 2005-06 εισήχθησαν σπουδαστές στο τμήμα Ανακαίνισης και Αποκατάστασης Κτηρίων<ref>{{Cite web|title = ΤΕΙ Θεσσαλίας|url = http://teilar.gr/tmimata/tmima.php?tid=19|website = teilar.gr|accessdate = 2015-10-26}}</ref> του τότε ΤΕΙ Λάρισας και νυν ΤΕΙ Θεσσαλίας<ref>{{Cite web|title = Τ.Ε.Ι. Θεσσαλίας - Κεντρική Σελίδα|url = http://teilar.gr/|website = teilar.gr|accessdate = 2015-10-26|first = ItBiz,|last = http://www.itbiz.gr}}</ref>. Από το ακαδημαϊκό έτος 2000-10 λειτούργησε και το τμήμα Πολιτικών Δομικών Έργων<ref>{{Cite web|title = ΤΕΙ Θεσσαλίας|url = http://teilar.gr/tmimata/tmima.php?tid=23|website = teilar.gr|accessdate = 2015-10-26}}</ref>. Με την αλλαγή του εκπαιδευτικού χάρτη της χώρας και το σχέδιο "ΑΘηνά", τα δύο τμήματα συγχωνεύθηκαν και πλέον λειτουργεί με ενιαία μορφή το τμήμα Πολιτικών Μηχανικών Τ.Ε.<ref>{{Cite web|title = ΤΕΙ Θεσσαλίας|url = http://teilar.gr/tmimata/tmima.php?tid=24|website = teilar.gr|accessdate = 2015-10-26}}</ref>, το οποία ανήκει στη Σχολή Τεχνολογικών Εφαρμογών (Σ.Τ.ΕΦ.) του Τ.Ε.Ι. Θεσσαλίας.
