Η ΕΘΑ είναιήταν ένα από τα ιδρυτικά μέλη της [[Εθνική Ποδοσφαιρική Ομοσπονδία Περιφέρειας Λευκωσίας|Εθνικής Ποδοσφαιρικής Ομοσπονδίας Περιφέρειας Λευκωσίας]] (ΕΠΟΠΛ) το 1960<ref>{{Cite web|url = http://www.epopl.com/index.php/omospondia/epopl-history|title = Ιστορία της ΕΠΟΠΛ|date = |accessdate = 1 Αυγούστου 2015|website = |publisher = [[Εθνική Ποδοσφαιρική Ομοσπονδία Περιφέρειας Λευκωσίας|ΕΠΟΠΛ]]|last = |first = |archiveurl = https://web.archive.org/web/20150801172838/http://www.epopl.com/index.php/omospondia/epopl-history|archivedate = 1 Αυγούστου 2015}}</ref> και αργότερα υπήρξε ιδρυτικό σωματείο της [[Αθλητική Ποδοσφαιρική Ομοσπονδία Εθνικοφρόνων Σωματείων Προαστίων Λευκωσίας|Αθλητικής Ποδοσφαιρικής Ομοσπονδίας Εθνικοφρόνων Σωματείων Προαστίων Λευκωσίας]] (ΑΠΟΕΣΠ), στις διοργανώσεις της οποίας συμμετείχε για αρκετά χρόνια.<ref name=":0" /> Το 1986 εντάχθηκε στη [[Δ΄ κατηγορία ποδοσφαίρου ανδρών Κύπρου|Δ΄ κατηγορία]] και στις τάξεις της [[Κυπριακή Ομοσπονδία Ποδοσφαίρου|Κυπριακής Ομοσπονδίας Ποδοσφαίρου]] (ΚΟΠ) μέσω του [[Πρωτάθλημα ένταξης|πρωταθλήματος ένταξης]].
Στην πρώτη συμμετοχή της στο πρωτάθλημα Δ΄ κατηγορίας, την [[Δ΄ κατηγορία ποδοσφαίρου ανδρών Κύπρου 1986-87|περίοδο 1986-87]], τερμάτισε στην έκτη θέση του ομίλου της.<ref name=":1" /> Την [[Δ΄ κατηγορία ποδοσφαίρου ανδρών Κύπρου 1987-88|επόμενη περίοδο]] τερμάτισε στην προτελευταία θέση και υποβιβάστηκε στα αγροτικά (τοπικά) πρωταθλήματα.<ref name=":2" /> Συνέχισε στις διοργανώσεις της ΑΠΟΕΣΠ. Το ποδοσφαιρικό τμήμα της ΕΘΑ Έγκωμης είναι ανενεργό.
