Μετά την οριστική του απομάκρυνση από το δικτατορικό καθεστώς ο Μητροπολίτης Παντελεήμων Α΄ εγκαταστάθηκεστηνεγκαταστάθηκε στην οικία της αδελφής του στην Αθήνα στην Πλάκα μαζί με την μητέρα του και την ανηψία του. Στις 5 Δεκεμβρίου 1974 η νέα Ιερά Σύνοδος επί Αρχιεπισκόπου Σεραφείμ αποκαθιστά ηθικά τον Παντελεήμονα αποσύροντας τις ψευδείς κατηγορίες. Εκοιμήθη στην Αθήνα στις 14 Ιουνίου 1979.<ref>Αγγελοπούλου, Αθανασίου Αν. (1998). Εκκλησιαστική Ιστορία. Ιστορία των δομών διοικήσεως και ζωής της Εκκλησίας της Ελλάδος (Εικοστός αιώνας). Θεσσαλονίκη: Εκδοτικός Οίκος Αδελφών Κυριακίδη, σελ. 67-68.</ref>
