* 2005: Έπαθλο Σωτήρης Παπασταμάτης από τον Πανελλήνιο Ιατρικό Σύλλογο.<ref>{{Cite web|url=https://m.naftemporiki.gr/story/1594805/o-stratigos-tis-elladas-sti-maxi-kata-tou-covid-19|title=O «στρατηγός» της Ελλάδας στη μάχη κατά του COVID-19|website=m.naftemporiki.gr|language=el|accessdate=2021-02-17}}</ref>
==Διαμάχες και Κριτική==
===Υπέρ-καταγραφές θανάτων από COVID-19===
Την 4η Μαΐου 2020 σε δημόσια ενημέρωση για την [[Πανδημία COVID-19|πανδημία του COVID-19]] στην Ελλάδα, ο Τσιόδρας παραδέχτηκε ότι σε ορισμένες περιπτώσεις, οι Ελληνικές υγειονομικές αρχές υπέρ-κατέγραφαν τους θανάτους από COVID-19. Ουσιαστικά, ο Τσιόδρας δήλωσε πως οποιοσδήποτε θάνατος με παρουσία του ιού [[SARS-CoV-2|SARScov2]] στον θανόντα καταγράφεται ως θάνατος από COVID-19 (την νόσο που κάποιες φόρες προκαλεί ο SARScov2). Ως παράδειγμα έκανε αναφορά σε περίπτωση εγκεφαλικής αιμορραγίας που καταγράφηκε ως θάνατος από COVID-19. Ο Τσίοδρας υπερασπίστηκε τον συγκεκριμένο τρόπο καταγραφής αν και έκανε αναφορά πως Ευρωπαϊκές χώρες όπως η Γερμανία δεν τον ακολουθούν.<ref>{{Cite web|url=https://www.protagon.gr/epikairotita/tsiodras-riskaroume-na-katagrafoume-perissoterous-thanatous-44342048580|title=Τσιόδρας: Ρισκάρουμε να καταγράφουμε περισσότερους θανάτους|website=Protagon.gr|language=el|accessdate=2021-03-07}}</ref>
===Εμπλοκή σε σκάνδαλο αγοράς εμβολίων και φαρμάκων===
Την περίοδο 2009-10 ο Σωτήρης Τσίοδρας είχε εμπλακεί ως εισηγητής του Κέντρου Ελέγχου Ειδικών Λοιμώξεων σε υπερβολικές αγορές εμβολίων και φαρμάκων για την [[γρίπη Η1Ν1]] επί υπουργού υγείας [[Δημήτρης Αβραμόπουλος|Δημήτρη Αβραμόπουλου]] στην κυβέρνηση του [[Κώστας Καραμανλής|Κώστα Καραμανλή]] ([[Νέα Δημοκρατία]]). Ποιο συγκεκριμένα ο Τσιόδρας πρότεινε την αγορά 24 εκατομμυρίων εμβολίων Η1Ν1 και επιπλέον φαρμάκων εναντίον της γρίπης συνολικής αξίας 234 εκατομμυρίων ευρώ από τις εταιρίες ''[[Roche]]'' και [[GlaxoSmithKline|''Glaxo Smithkline'']] για μια χώρα 10 εκατομμύριων (όπως η Ελλάδα), την ίδια στιγμή η Γερμανία των 80 εκατομμυρίων παρήγγειλε 50 εκατομμύρια εμβόλια ενώ η Ιταλία των 60 εκατομμύριων 24 εκατομμύρια. Η μεγάλη πλειοψηφία αυτών των εμβολίων δεν χρησιμοποιήθηκε, ενώ κάποιες παραγγελίες ακυρώθηκαν από την επόμενη υπουργό υγείας Μαριλίζα Ξενογιαννακοπουλου στην [[Κυβέρνηση Γεωργίου Α. Παπανδρέου 2009|κυβέρνηση του Γιώργου Παπανδρέου]] ([[Πανελλήνιο Σοσιαλιστικό Κίνημα|ΠΑΣΟΚ]]). Η υπόθεση ερευνήθηκε από εισαγγελείς στα πλαίσια της έρευνας ενάντια στην διαφθορά. <ref>{{Cite web|url=https://www.tanea.gr/2009/06/16/greece/kokteil-emboliwn-gia-toys-ilikiwmenoys/|title=Κοκτέιλ εμβολίων για τους ηλικιωμένους|ημερομηνία=2009-06-16|website=ΤΑ ΝΕΑ|language=el|accessdate=2021-03-07}}</ref><ref>{{Cite web|url=https://crashonline.gr/paraskinio/1458243/krataei-chronia-afti-i-kolonia-diafores-kai-omoiotites-me-to-2009-kai-ta-24-ek-emvolia/|title=Κρατάει χρόνια αυτή η κολόνια - Διαφορές και ομοιότητες με το 2009 και τα 24 εκ. εμβόλια!|ημερομηνία=2020-04-28|website=CrashOnline.gr {{!}} Η Online έκδοση του περιοδικού CRASH!|language=el|accessdate=2021-03-07}}</ref><ref>{{Cite web|url=https://mydimosio.gr/eidiseis/o-tsiodras-o-avramopoylos-to-skandalo-ton-emvolion/|title=Ο Τσιόδρας, ο Αβραμόπουλος και το σκάνδαλο των εμβολίων|ημερομηνία=2020-04-30|website=MyDimosio|language=el|accessdate=2021-03-07}}</ref>