Οι [[Α.Ο. Ορφέας Ξάνθης|Ορφέας Ξάνθης]] , [[Α.Σ. Σαντορίνη 2020|Σαντορίνη 2020]] και [[Γ.Α.Σ. Ιάλυσος]], στη συνέχεια απέσυραν τη συμμετοχή τους, ενώ στους [[Παναχαϊκή Γ.Ε. (ποδόσφαιρο)|Παναχαϊκή]], [[Α.Σ. Θεσπρωτός Ηγουμενίτσας|Θεσπρωτός]], [[Α.Ο. Καβάλα (ποδόσφαιρο)|Καβάλα]]<ref>{{Cite web|url=https://www.sdna.gr/podosfairo/865187_eea-kopikan-kabala-thesprotos-kai-apohairetoyn-tis-epaggelmatikes-katigories|title=ΕΕΑ: «Κόπηκαν» Καβάλα, Θεσπρωτός και αποχαιρετούν τις επαγγελματικές κατηγορίες!|website=sdna.gr|ημερομηνία=2021-08-03|language=el|accessdate=2021-08-03}}</ref> δεν χορηγήθηκε πιστοποιητικό συμμετοχής από την Επιτροπή Επαγγελματικού Αθλητισμού, απαραίτητο για τη συμμετοχή στο επαγγελματικό πρωτάθλημα της Σούπερ Λιγκ 2.
Στις 14 Αυγούστου η ΕΠΟ κάλεσε τις 4 ομάδες της Γ' Εθνικής οι οποίες τερμάτισαν μέχριστην την3η και 4η θέση της βαθμολογίας των ομίλων των μπαράζ ανόδου ([[Ποσειδών Νέας Μηχανιώνας|Ποσειδώνας Μηχανιώνας]], [[Αχέρων Καναλακίου]], [[Πανιώνιος (ποδόσφαιρο)|Πανιώνιος]], [[Α.Π.Σ. Ζάκυνθος|Ζάκυνθος]]), να αναπληρώσουν τις κενές θέσεις. Από αυτές τις ομάδες μέχρι στιγμής οι Πανιώνιος και Ζάκυνθος 1961 φαίνεται να είναι θετικές<ref>{{cite web|url=https://www.sport24.gr/football/panionios-tha-apantisoyme-thetika-stin-prosklisi-gia-symmetochi-sti-super-league-2.9324274.html|title=Πανιώνιος: "Θα απαντήσουμε θετικά στην πρόσκληση για συμμετοχή στη Super League 2"|publisher=sport24.gr}}</ref><ref>{{Cite web|url=https://ioniansports.gr/aps-zakynthos-v-ethniki-mpike-to-proto/|title=ΑΠΣ Ζάκυνθος-Β΄ Εθνική: Μπήκε το πρώτο «λιθαράκι» • Ionian Sports|ημερομηνία=2021-08-14|website=Ionian Sports|language=el|accessdate=2021-08-15}}</ref>, καθώς αναμένονται και άλλες απαντήσεις. Εφόσον δεν αναπηρωθούναναπληρωθούν όλες οι ομάδες, θα κληθούν και οι ΠΑΕ που τερμάτισαν στις δυο τελευταίες θέσεις των ομίλων της Football League και υποβιβάστηκαν στη Γ΄ Εθνική.<ref>{{Cite web|url=https://www.sportime.gr/podosfairo/superleague2/super-league-2-nea-apochorisi-apo-to-protathlima-pos-anaplirononte-ta-kena/|title=Super League 2: Νέα αποχώρηση από το πρωτάθλημα! Πως αναπληρώνονται τα κενά!|last=sportime.gr|ημερομηνία=2021-08-02|website=sportime.gr|language=el|accessdate=2021-08-15}}</ref>
