Φυσικές
• Λίμνη Μόρφη (Ήπειρος)
• Πωγωνίτσα (Στερεά Ελλάδα)
• Λίμνη Προντάνη (Θεσπρωτία, Ήπειρος)
• Λίμνη Κόκκαλα (Στερεά Ελλάδα)
• Μικρή Σαλτίνη (Στερεά Ελλάδα)
• Αεροφωλιές (Μακεδονία)
• Λίμνη Σαΐτα (Ήπειρος)
• Λίμνη Αβιλαριάς (Στερεά Ελλάδα)
• Λίμνη Μουστός (Πελοπόννησος)
• Λίμνη Νυμφών (Έβρος, Θράκη)
• Λίμνη Τσεκούρι (Έβρος, Θράκη)
• Λίμνη Σκέπη (Έβρος, Θράκη)
• Λίμνη Σπίτια (Έβρος, Θράκη)
• Λίμνη Γυναίκα (Έβρος, Θράκη)
• Στεφανιάδα (Καρδίτσα, Θεσσαλία)
Τεχνητές
• Λίμνη Γρατινής (Ροδόπη, Θράκη)
• Λίμνη Ιλαρίωνα (Κοζάνη & Γρεβενά, Μακεδονία)
Αποξηραμένες
• Λίμνη Αιματόβου (Πιερία, Μακεδονία)