Ο Στυλιανός Φωτάκης γεννήθηκε στις [[Μέλαμπες ΡεθύμνουΡεθύμνης]] Κρήτης[[Κρήτη]]ς. Σπούδασε νομικά στο [[Πανεπιστήμιο Αθηνών]] και μετά την αποφοίτησή του επέστρεψε στη Κρήτη ασκώντας δικηγορία στον Βάμο Αποκορώνου όπου και η τότε έδρα των δικαστικών Αρχών. Υπήρξε κατ΄ επανάληψη βουλευτής της αυτόνομης βουλής της Κρήτης αντιπροσωπεύοντας την επαρχία του μέχρι το 1889. Στη συνέχεια υπήρξε ένας από τους πρωτεργάτες της [[Κρητική Επανάσταση (1895-1898)|Κρητικής Επανάστασης (1895-1898)]] όπου συνεργαζόμενος με τον πρωτοδίκη [[Μανούσος Κούνδουρος|Μ. Κούνδουρο]], [[Γεώργιος Μυλωνογιάννης|Γ. Μυλωνογιάννη]] και άλλους επιφανείς Κρητικούς εξελέγη αντιπρόεδρος της Μεταπολιτευτικής Επιτροπής η οποία και ανέλαβε την νέα επαναστατική δράση, συντάσσοντας σχετικό υπόμνημα προς τις Μεγάλες Δυνάμεις και την ελληνική κυβέρνηση.
Κατά την επανάσταση που ακολούθησε με αποκορύφωμα την [[πολιορκία του Βάμου]] ο Στυλιανός Φωτάκης είχε αναγνωριστεί ως οπλαρχηγός της περιοχής του Αγίου Βασιλείου.
