Παρεμβολή RNA: Διαφορά μεταξύ των αναθεωρήσεων

Περιεχόμενο που διαγράφηκε Περιεχόμενο που προστέθηκε
Διάσωση 2 πηγών και υποβολή 0 για αρχειοθέτηση.) #IABot (v2.0
Esslet (συζήτηση | συνεισφορές)
Επιμέλεια + σήμανση παραπομπών
Γραμμή 1:
[[Αρχείο:Rna interference plos.png|thumb|300px|right|Τα κύτταρα χρησιμοποιούν το ένζυμο [[dicer]] για να κοντύνουν τη διπλή αλυσίδα του [[RNA]] για να δημιουργήσουν θραύσματα ή [[small interfering RNA]] ή [[microRNA]]. Μία εξωγενής προέλευση διπλή αλυσίδα dsRNA ή ένα ενδογενές προ-miRNA μπορεί να επεξεργαστεί από το dicer και να ενσωματωθεί στο σύμπλοκο αυτό (RNA-induced silencing complex) (RISC), το οποίο στοχεύει στο μονής αλυσίδας [[αγγελιοφόρο RNA]] (μεταφέρει τη γενετική πληροφορία) και να προκαλέσει την καταστολή της μετάφρασης των στοχεσθέντων γονιδίων;<ref name="Hammond2000">{{cite journal |author=Hammond S, Bernstein E, Beach D, Hannon G |title=An RNA-directed nuclease mediates post-transcriptional gene silencing in Drosophila cells |journal=[[Nature (journal)|Nature]]|volume=404 |issue=6775 |pages=293-6 |year=2000 |id=PMID 10749213}}</ref><ref name="Matzke">{{cite journal | author = Matzke MA, Matzke AJM. | year = 2004 | title = Planting the Seeds of a New Paradigm. | journal = PLoS Biol | volume = 2 | issue = 5 | pages = e133 | | url = http://dx.doi.org/10.1371/journal.pbio.0020133 | id = PMID 15138502 }}</ref>]]{{Χωρίς παραπομπές|02|01|2020}}
H '''παρεμβολή του RNA''' ή ('''[[RNA interference]]''' ή '''[[RNAi]]''') είναι ένας μηχανισμός ρύθμισης της γονιδιακής έκφρασης στην οποία το [[RNA]] καταστέλλει την έκφραση συμπληρωματικών προς αυτώναυτό [[γονίδιο|γονιδίων]]. Φυλογενετικά ο μηχανισμός αυτός φαίνεται να έχει προέλθει από πρώιμους αντιικούςαντι-ιικούς μηχανισμούς ανοσίας και παίζει σημαντικό ρόλο στην γονιδιακή ρύθμιση, [[εξελικτική βιολογία]] και διατήρηση του γονιδιώματος. Οι Fire και Mello βραβεύθηκαν το 2006 με το [[Νόμπελ στην Ιατρική]] για την έρευνά τους και τις ανακαλύψεις τους στην παρεμβολή του RNA.
 
H παρεμβολή του RNA ή '''[[RNA interference]]''' ή '''[[RNAi]]''') είναι ένας μηχανισμός ρύθμισης της γονιδιακής έκφρασης στην οποία το [[RNA]] καταστέλλει την έκφραση συμπληρωματικών προς αυτών [[γονίδιο|γονιδίων]]. Φυλογενετικά ο μηχανισμός αυτός φαίνεται να έχει προέλθει από πρώιμους αντιικούς μηχανισμούς ανοσίας και παίζει σημαντικό ρόλο στην γονιδιακή ρύθμιση, [[εξελικτική βιολογία]] και διατήρηση του γονιδιώματος. Οι Fire και Mello βραβεύθηκαν το 2006 με το [[Νόμπελ στην Ιατρική]] για την έρευνά τους και τις ανακαλύψεις τους στην παρεμβολή του RNA.
 
== Ο μηχανισμός RNAi ==
 
Ο μηχανισμός RNAi άρχεται από το ένζυμο [[dicerDicer]], το οποίο διασπά την διπλή αλυσίδα RNA (dsRNA) για να δημιουργήσει κοντά θραύσματα διπλής αλυσίδας 20–25 ζευγαριώνζευγών βάσεων. Tο ειδικό αυτό RNA ανακαλύφθηκε όταν παρατηρήθηκε ότι τόσο η senseνοηματική όσο και η antisenseαντινοηματική ακολουθία του RNA, ήταν εξίσου αποτελεσματικές στην καταστολή της γονιδιακής έκφρασης συγκεκριμένων γονιδίων. Παρασκευάσματα οποιουδήποτε τύπου (υποθετικά) μονόκλωνου RNA περιείχε προσμίξεις μικρών ποσοτήτων δίκλωνου RNA. Mελέτες ''in vitro'' δείχνουν ότι το δίκλωνο RNA αποικοδομείται (με δαπάνη ΑΤΡ) παράγοντας [[ολιγονουκλεοτίδιο|ολιγονουκλεοτίδια]] μήκους 21-23 βάσεων. Αυτά τα μικρά τμήματα RNA oνομάστηκαν μικρά παρεμβαλλόμενα RNA ([[siRNA]], ([[short interference RNA]]). Δημιουργούνται με αποκοπές στα 3’ άκρα ενός μεγαλύτερου δίκλωνου RNA και προκύπτουν siRNA θραύσματα, (δίκλωνα) με ανισοτελή άκρα μήκους 2 βάσεων. To ίδιο ένζυμο ένζυμο (Dicer) που δημιουργεί τα microRNA καταλύει τη διάσπαση αυτή. Συνεπώς τα miRNA έχουν μήκος περίπου 22bp και παράγονται σε πολλά [[ευκαρυωτικά κύτταρα]] από τη διάσπαση μεγαλύτερων μεταγραφημάτωνμεταγράφων. Λειτουργούν με σύζευξη βάσεων πάνω στο [[mRNA]] στόχο σχηματίζοντας δίκλωνες περιοχές πού είναι επιδεκτικές στη διάσπαση από ενδονουκλεάσες. Η αποικοδόμηση του mRNA-στόχου παρεμποδίζει και την έκφρασή του. H ρύθμιση του [[mRNA]] με [[micro-RNA]] βρίσκει απομίμηση στο φαινόμενο της παρεμβολής RNA (RNA interference).
 
== Εφαρμογή της τεχνικής ==
[[Αρχείο:Rnai phenotype petunia crop.png|thumb|250px|right|Παράδειγμα φυτού στο οποίο τα γονίδια που είναι υπεύθυνα για τις χρωστικές έχουν κατασταλεί με RNAi. Το αριστερό φυτό είναι ο θετικός μάρτυρας, το δεξί περιέχει τρανσγονίδια που καταστέλλουν τα γονίδια της χρωστικής του λουλουδιού.]]
Η τεχνική του RNA interference χρησιμοποιείται σήμερα εκλεκτικά στην καταστολή ευκαρυωτικών γονιδίων. Η τεχνική των RNAιRNAi αποτελεί τη μέθοδο εκλογής για την απενεργοποίηση ευκαρυωτικών γονιδίων και περιλαμβάνει την εισαγωγή μικρών δικλωνωνδίκλωνων RNA, των οποίων ο ένας κλώνος είναι συμπληρωματικός του RNA στόχου και επάγουν την αποικοδόμησή του. Τα RNA interference σχετίζονται με φυσικές λειτουργίες καταστολής της γονιδιακής έκφρασης. [[Φυτά]] και [[μύκητες]] παρουσιάζουν τέτοιου τύπου καταστολή RNA (post transcriptional gene silencing), στην οποία δίκλωνο [[dsRNA]] παρεμποδίζει την έκφραση ενός γονιδίου. Μία “πρόχειρη” πηγή τέτοιου RNA στόχου μπορεί να είναι ένας πολλαπλασιαζόμενος [[ιός]], και ο φυσικός μηχανισμός μπορεί να έχει εξελιχθεί σαν άμυνα εναντίον ιικών μολύνσεων. Όταν ένας ιός μολύνει φυτικό κύτταρο, ο σχηματισμός του dsRNA προκαλεί την καταστολή της έκφρασής του από το φυτικό γονιδίωμα. Το siRNA μπορεί να εξαπλωθεί σ’ όλο το φυτό συστηματικάσυστημικά, πιθανόν και μέσω της κίνησης του ίδιου του ιού. Έτσι, μία RNA -εξαρτώμενη [[RNA πολυμεράση]] μπορεί να χρησιμοποιεί το siRNA σαν εκμαγείο και να παράγει πολλαπλά αντίγραφά του που καταστέλλουν τον RNA-στόχο.
 
== Αναφορές ==