Το πρωτάθλημα της Γ΄ Εθνικής ποδοσφαίρου ανδρών της περιόδου 1996-97 διεξήχθη σε δύο ομίλους με τη συμμετοχή 36 ομάδων. Με την ολοκλήρωση του πρωταθλήματος την άνοδο στην Β΄Εθνική εξασφάλισαν ο Εθνικός Αστέρας, η Καλλιθέα , η Αναγέννηση Καρδίτσας και οι Λύκοι Καλοχωρίου. Υποβιβάστηκαν στη Δ΄ Εθνική οι ομάδες: Ηλυσιακός, Ηρόδοτος, Πάτρα, Ένωση Ρόδου-Διαγόρα, Βαρβασιακός, Αλμωπός Αριδαίας, Α.Σ. Λαμία, Ηρακλής Πτολεμαΐδας, Αναγέννηση Γιαννιτσών, Α.Ε. Νιγρίτας και Αναγέννηση Κολινδρού. Στα αξιοσημείωτα του πρωταθλήματος ήταν ο υποβιβασμός του Ατρόμητου στη Δ΄ Εθνική για πρώτη φορά στην ιστορία του.[1]